Wenn Sie mit Verzeichnissen arbeiten, weil Ihre Struktur Ihrer Website sehr komplex wird, müssen Sie bei den Links die Verzeichnisse mit angeben. Zusätzlich können Sie auch über die Angabe ".\verzeichnis\seite.htm" angeben, dass er immer von dem Hauptverzeichnis ausgeht, auch wenn Sie den Link in einem Unterverzeichnis aufrufen. Empfehlenswert ist es eh nur bei komplexen Seiten (über 200 Seiten meiner Meinung nach). Verzeichnisse selber sind wichtig, um z.B. die Bilder unterzubringen.
Bei der Pfadangabe von Links wird gerne anstatt dem "/" ein "\" gesetzt. Dies ergibt im Browser von Netscape Probleme, hingegen moniert der Microsoft Internet-Explorer die falsche Schreibweise nicht und führt sie einfach aus.
In jedem Verzeichnis sollte eine index.htm existieren, da ansonsten unter Umständen bei der URL ohne Datei der Inhalt dieses Ordners aufgelistet wird oder nur eine Fehlermeldung kommt.